Uma engenheira de computação investiga a divisão de desenvolvimento sigiloso de sua empresa, que ela acredita estar por trás do desaparecimento de seu namorado.

O desaparecimento do detetive Harry Goodman faz com que seu filho Tim parta à sua procura. Ao seu lado ele conta com Pikachu, o antigo parceiro Pokémon de seu pai, que perdeu a memória recentemente. Juntos, eles percorrem as ruas da metrópole de Ryme City, onde humanos e Pokémon vivem em harmonia... por enquanto.